DYNADIV

Anthropisation et DYNAmique de la DIVersité Génétique des Plantes

Présentation des thématiques et activités

L'équipe DYNADIV réalise ses recherches sur l'(agro)biodiversité des plantes. Différentes espèces sont utilisées, appartenant à de grands groupes botaniques comme les palmiers et les annonacées, mais aussi des plantes alimentaires et leurs apparentées sauvages comme le mil, l’igname, le café,  le fonio, le riz.

Nos travaux sont menés en collaboration avec des équipes locales et internationales, au Sénégal avec l’ISRA, au Cameroun avec l’ENS, au Pérou avec UNMSM, au Niger avec l’UAM, au Bénin avec l’Université De Dassa. Ces activités sont réalisées dans le cadre de laboratoires mixtes internationaux (LMI LAPSE au Sénégal), de jeunes équipes associées (AVACLI au Niger) et au sein d’un observatoire (Pérou).

 

Contexte scientifique

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La biodiversité décroît, et de nombreuses espèces disparaissent dans ce que beaucoup appellent la 7eme extinction. Cette extinction est l’effet d’une utilisation accrue de l’espace ainsi que d’une utilisation de plus en plus importante d’énergies fossiles depuis les révolutions agricoles et industrielles. Cette biodiversité se retrouve de plus en plus dans un contexte anthropisé, associé aux zones d’agriculture et d’ l’élevage. Cette biodiversité recèle une valeur pour l’adaptation de notre agriculture, de nos médicaments

Cette agro biodiversité reste encore paradoxalement assez méconnue : quelle diversité existe au sein des compartiments sauvages et cultivés ? Comment les 12 000 ans d’agriculture ont modifié la diversité des plantes cultivées et celle de leurs apparentées sauvages ? Mais encore aujourd’hui dans les forêts tropicales, nous n’avons qu’une idée approximative de comment cette biodiversité se maintient, évolue face aux changements récents ou suite aux changements de climat associés au dernier maximum glaciaire.

Notre équipe cherche à comprendre cette diversité, son évolution et à la relier aux facteurs qui la déterminent. Elle cherche aussi à comprendre comment ces plantes s’adaptent à un environnement variable. L’ensemble de ces recherches fournit un cadre scientifique pour la conservation de la biodiversité, mais aussi l’amélioration des espèces cultivées, base de notre alimentation mondiale.

 

Questionnements scientifiques et approches méthodologiques

De sertNous abordons ces recherches à travers des approches de génomique des populations, de phylogénie, de botanique avec un focus populationnel et interspécifique. La recherche des déterminants de cette biodiversité s’appuie sur des connaissances interdisciplinaires : climatologie, archéologie, anthropologie, géologie. Une place importante est donnée à la compréhension des processus en utilisant la modélisation de l’histoire évolutive, et de la modélisation de niche. L’équipe aborde ces questions avec des outils communs que sont la génétique et l’utilisation d’approche de séquençage haut-débit.

Les questions qui sont abordées dans l’équipe :

  1. Quelle est l’histoire évolutive des formes cultivées comme le mil, l’igname, le fonio, le riz ?
  2. Quelle adaptation génétique à des variations climatiques sur les plantes cultivées et sauvages ?
  3. Comment la biodiversité des forêts tropicales a été modelée par les changements environnementaux & géologiques ?

 

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Composition de l'équipe

  • Dr Yves Vigouroux, Directeur de Recherche, IRD, responsable d’équipe
  • Dr Valérie Poncet, Chargée de recherche, IRD
  • Dr Thomas Couvreur, Chargé de recherche IRD
  • Dr Nora Scarcelli, Chargée de Recherche IRD
  • Dr Anne-Céline Thuillet, Chargée de Recherche IRD
  • Dr Jean-Louis Pham, Chargé de Recherche IRD
  • Dr Cécile Beerthouly, Chargée de recherche IRD
  • Dr Adeline Barnaud, Chargée de Recherche IRD
  • Dr Jérôme Duminil, Chargé de Recherche, IRD
  • Cédric Mariac, Ingénieur d’étude IRD
  • Leila Zekraoui, Ingénieur d’étude IRD
  • Marie Couderc, Technicienne de recherche, IRD

Accueils en cours

  • Dr Bénédicte Rhoné, Post-doctorante ANR
  • Dr Concetta Burgurella, Post-doctorante Agropolis Fondation
  • Dr Gilles Dauby , Post-doctorant FRB
  • Issaka Salia Ousseini, Etudiant en thèse (ARTS/Ambassade de France)
  • Priscilla Ambrosio Moreira, Etudiante en thèse (CAPES)
  • Adama Faye, Etudiant en thèse (ARTS)
  • Roland AKAKPO, Etudiant en thèse (BID/ARTS)
  • Rémi TOURNEBIZE, Etudiant en thèse (Univ. M. 2)
  • Glato KODJO, Etudiant en thèse (Univ. Lomé, Ambassade de France)

Projets en cours

  • ANR Bioadapt ADAPTINWILD (2012-2016), Agrobiosphere CERAO (2013-2017), Blanche AFRICROP (2013-2017), Repoc MILDIV (2013-2015)
  • Projet ARCAD-Agropolis Fondation (2009-2015), ARCAD-FEDER (2012-2015), ARCAD-Bâtiment (2015-…)
  • Projets Agropolis Foundation: CHLORODIV (2013-2015), RAPHIA (2015-2017), ADAPTINCROP (2015-2017), GECOFA (2015-2017)
  • Projet AMMA2050 –UKAID/NERC
  • RB RAINBIO (2014-2015)


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