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ADaptation des plantes à leur ENvironnement et au Stress

 

Contexte et objectifs généraux

Comprendre le potentiel d’adaptation des plantes tropicales à des contraintes environnementales nouvelles constitue un enjeu majeur pour le développement d’une agriculture durable au Sud et pour une meilleure prédiction de la réponse des écosystèmes aux changements climatiques.

L’équipe ADvENS étudie l’évolution des génomes, des transcriptomes et des métabolismes en relation avec la divergence adaptative afin d’identifier les répertoires et modules de gènes et de métabolites associés à des traits fonctionnels d’intérêt agronomique ou écologique. L’équipe s’intéresse particulièrement aux graines des arbres des forêts tropicales qui présentent une extrême sensibilité aux contraintes hydriques et thermiques. La complémentarité des compétences des membres de l’équipe permet le développement d’approches intégratives couplant génomique, biochimie et physiologie.

Projets

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Parcelle de caféiers, île de La Réunion

  • Caractérisation et valorisation d’une espèce endémique des forêts réunionnaises : le caféier marron (Coffea mauritiana Lam.) (Projet CAFEDIV financé par l'UE et la Région Réunion)
  • Traits fonctionnels d’adaptation des graines tropicales : métabolisme lipidique et longévité des semences de palmiers (projets LipidMap et GermPalm, financés par PalmElit SAS, en collaboration avec l’équipe F2F)
  • Organisation des génomes d’arbres tropicaux : analyse du génome de Coffea canephora (projets ANR Coffeaseq & GenomeCafe, en partenariat avec le CEA-Genoscope et le CIRAD)
  • Plasticité fonctionnelle associée à la polyploïdie : changements de l'expression génique comme source de variation phénotypique chez les caféiers (projet ANR PuceCafe), GenomeHarvest projet étendard Agropolis Fondation)
  • Effets de l’environnement sur le transcriptome et métabolisme des graines de caféiers (projet FEADER, financé par l’UE et la Région Réunion)
  • Ecologie de la sensibilité à la dessiccation des graines: étude des relations entre physiologie des graines et ampleur des contraintes subies en conditions naturelles (projets Dessical et Corifor, financements GOPS et MOM)
  • L’équipe s’implique également dans la conservation de la biodiversité. Elle a notamment en charge le Centre de Ressources Biologiques pour les Coffea sauvages (CRB Coffea) au sein du réseau Inter-Trop 

 

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Composition de l'équipe

Accueils en cours

  • Edith Garot, Thèse 2016-2019 (Université Montpellier)
  • Anna Stavrinides, Post-doc 2017-2018, IRD

 

Accueils passés

  • Simon Foulquier, Master2, 2016 (Université Toulouse III)
  • Aldecinei SIQUEIRA BASTOS, Post-Doc 2014-2015, CNPq (Brésil, Embrapa Manaus)
  • Chloé GUERIN, Thèse 2013-2015, (UM, co-encadrement F2F)
  • Kheira ERROUANE, Thèse 2013-2015, (Université d’Oran)

 

Pvbmt 1

 

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Autres partenaires: CRF, Kenya; CEFE, CNRS; UNC, Nouvelle-Calédonie,CIRAD, Université de la Réunion